关重要的转变来自后宫。何进的妹妹，皇子刘辩的生母何太后此时已是太后最有力竞争者，在权衡利弊后彻底倒向了兄长。她以皇帝遗孀皇子生母的身份，下旨明确支持何进，指责蹇硕矫诏谋逆，图害大臣，罪在不赦”为何进的军事行动提供了关键的宫廷合法性。何氏的倒戈，使得宦官集团试图通过影响太后、以宫廷名义压制何进的企图落空。
何进不再迟疑，以奉太后旨意、讨伐逆臣的名义，指挥大军打开宫门，攻入南宫。目标明确诛杀蹇硕，夺取西园禁军控制权。战斗或许并不漫长但足够血腥。负隅顽抗的蹇硕及其少数死党被斩杀，其统领的西园禁军部分被击溃，部分见大势已去而投降。何进迅速接管了西园的指挥权，彻底解除了宦官手中最有力的武装。
以张让赵忠为首的十常侍集团，见蹇硕身死，军权丧失深知已无力正面抗衡手握重兵、又有太后和世家支持的何进。为了保全性命，他们暂时选择了蛰伏，集体向何进何太后请罪，表示顺服并暂时不再公开反对拥立刘辩。何进虽志在彻底铲除宦官，但也深知宦官盘根错节，若逼之过急恐生变故，眼下首要任务是先定新君，于是暂时接受了宦官的表面屈服，但诛除之心未减。
障碍铲除何进随即以嫡长子继承乃祖宗法度为名，联合三公九卿，奏请拥立时年十四岁的皇子刘辩即位。
中平六年在何进大军的护卫和朝臣的拥戴下，刘辩于南宫崇德殿前即皇帝位，改元光熹，大赦天下。尊其生母何氏为皇太后，临朝称制处理政务。而何进以大将军身份，录尚书事，总揽朝政大权，其弟何苗也被任命为 车骑将军，掌管部分禁军。何氏外戚的权力，至此达到顶峰，牢牢掌控了洛阳的军政大权。
为了安抚因刘辩即位而失势的另一方，也为了显示新朝的宽仁与稳定宗室，何进奏请新帝，封皇子刘协为陈留王。这一举措，暂时平息了部分支持刘协的宦官残余势力和宗室成员的不满，将潜在的内部矛盾进行了绥靖处理。
至此，灵帝死后的第一轮权力洗牌，以何进为代表的外戚—世家联盟的全面胜利而告终。刘辩的帝位初步稳固，何进威震朝野。
然而表面的平静之下，暗流更加汹涌。宦官集团虽遭重创但核心未灭，张让等人伏低做小，暗中等待反扑之机，以袁绍为代表的世家力量在拥立过程中出力甚巨，其政治野心也随之膨胀，与何进的合作并非铁板一块；而那位远在凉州手握重兵、态度暧昧的皇长子刘朔，其生母仍在宫中，其存在本身，就是悬在何进头顶的达摩克利斯之剑。