郑芝龙率领船队进攻久贺岛的同时，郑芝虎也率十艘三桅海船驶入了长崎港。
见到有海船到来，一艘倭国桨帆船远远迎了过来，船上站着长崎港的官吏。
“你们是哪家的船队，事先可有申请入港？”日本港口官吏仰着脖子高声叫道。
三桅福船太过高大，他乘坐的桨帆船不到三桅福船一半高，不得不仰着脖子喊话。明国来长崎贸易的海商，一部分呆在长崎港口，在陆地上专门划有一块地方供明商居住。而明国大的商行皆呆在长崎外海的五岛，都不愿住在拥挤的长崎港中。不过贸易必须在长崎港进行，所以五岛的明国海船也经常来长崎港，但来之前需要先向港口方面申请。
面对这日本官吏的质问，郑芝虎冷冷一笑，并不理会，而是接连发出一串命令。
随着郑芝虎的命令，随行的其他海船都绕过日本桨帆船，向着港口内猛地扑去，扑向停在海面上那一艘艘海船。
“八嘎呀路！”日本官吏怒声叫道。
在叫骂声中，高大的福船从桨帆船侧驶过，差点蹭着桨帆船，这要是被蹭着，桨帆船非得被掀翻在海中不可。日本官吏吓得紧紧抓住缆绳，脸色苍白的道，“快，快回去报信，明国海商要作乱了！”
那些没参加会议的海盗船只停泊位置早就查清楚了，十艘三桅福船各自找到目标，迅速扑了过去，无数飞爪抛出，把海盗船和福船紧紧连在一起，船上士兵先是一轮火铳射出，然后几枚手雷抛到海盗船上，趁着爆炸出来的烟雾，抓住缆绳飞扑过去，展开了接舷战。然后发现，夺船非常顺利，顺利的超出了想象，基本上每一艘福船都没有遇到激烈的反抗。
因为停泊在长崎港口，安全方面自然由倭国负责，海盗们没有什么警惕心，船上大半的海盗都住在岸上，趁着难得的悠闲时光，整日里在岸上花天酒地。倭国很穷，但长崎是倭国唯一对外港口，却非常的繁华，这里有大量的人口，有着绵延的建筑，各种商店应有尽有，酒馆妓院到处都是。每年的夏秋季节，来长崎的明国海船一般都超过百艘，船员数量几万人，这几万海员要在长崎生活三四个月时间，直到冬季西北季风起，才会扬帆返程。几万人海员给长崎带来了很大的繁荣，有无数的倭人靠着海贸维生。
海员们都有钱，而海盗的钱来的更快，花的自然更爽快。这些海盗每天都是在酒馆妓院花天酒地，大部分根本不在船上住。
所以，进攻自然顺利的很。用了不过半个时辰，便把所有海盗船全部俘虏，杀
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