这些男丁都经历了思想教育，再加上看到实实在在的分田，无不对禁卫军感激涕零。于是周雄趁机宣布招募农兵，农兵不用出去打仗，而是集合起来保护家园，防止李公子和士绅的军队再次杀回。农兵农忙时种地，农闲时操练，平时没有粮饷，操练时会有补贴。
对此百姓们自然没有异议，被释放的这些俘虏纷纷报名，摇身一变成为了农兵的一员。
自此，整个南阳府的局面终于打开，然后在此基础上，开始建立镇一级官府，每个县下设立数个镇，镇以下设村，村长镇长都纳入朝廷编制。等到村镇两级官府都成立以后，整个南阳府才算彻底纳入禁卫军系统。
孙传庭终于等到了圣旨，圣旨中对他击败红巾贼收复南阳的功劳进行了表彰，功过相抵，恢复了他太子太保的荣衔，军中立功的将士皆有升赏，比如李鸿基便被提升为南阳总兵。对此李鸿基又喜又忧，喜的是终于成为了总兵这一级的武将，忧的是以后驻地便成了南阳，没法再回黑山了，而在南阳远没有在草原上自由自在。
在圣旨中，朱由检告诉孙传庭，暂时留在南阳，主持南阳的改革。勤练兵马，等到夏粮收获以后才出兵攻打湖广。
对此，孙传庭自然没有什么异议。数月的大战，耗费钱粮无数，幸亏有早已掌控的河南府洛阳的支撑，才能打到现在。然而洛阳的粮食也差不多快用完了，根本支撑不了下一场战争。