蒋奇对袁绍说：“审配在任独揽权力，宗族大，兵力强，而且两个儿子在南方，他必定想反叛。”郭图、辛评也这么认为。
袁绍于是任命孟岱为监军，代替审配把守邺县。护军逢纪同审配不和，袁绍就这件事询问逢纪的意见，逢纪回答说：“审配天性刚烈率直，每次所说的话和所做的事，都仰慕古人的节操，不会因为两个儿子在南边而做不义的事情，您不要对他怀疑。”袁绍说：“你不是讨厌他吗？”逢纪说：“从前所争的属于个人私事，现在所说的是国家大事。”袁绍说：“太对了。”于是没有罢免审配。自此审配、逢纪的关系更融洽了。
建安七年（公元202年），袁绍发病去世，众人认为袁谭为长子应为继承人，打算拥立他。但审配和逢纪向来为袁谭所厌恶，又和辛评、郭图有过节，担心袁谭即位后加害，因而私下改袁绍遗命，立袁尚继位。
袁谭不能继位，自号车骑将军，屯黎阳。袁尚不增兵给袁谭，更命令部下逢纪跟随紧盯。袁谭要求配兵却为审配所拒绝，一怒之下杀了逢纪，兄弟二人渐生嫌隙。
建安七年（公元202年），曹操攻打袁谭，袁谭向袁尚求救，袁尚害怕袁谭得到士兵后不还，于是留审配留守，自领士兵救援。战后，袁谭要求袁尚增送铠甲及士兵，但遭拒绝。在郭图、辛评挑拨下，袁谭攻袁尚，但战败，退回南皮。期间，审配写信责备袁谭，袁谭得信怅然，登城而泣。
建安九年（公元204年），袁尚又到平原去进攻袁谭，留审配、苏由镇守邺城。曹操进军到洹水，苏由打算为曹操作内应，因密谋泄露，苏由就出城投奔曹操。曹操大军到达邺城后，上筑土山，下挖地道，发动进攻。袁尚委任的武安县县长尹楷驻军毛城，以保护通向上党的粮道。四月，曹操留曹洪继续攻打邺城，亲自统军进攻尹楷，击败尹楷后回师。又去进攻镇守邯郸的袁尚部将沮鹄，攻陷邯郸。审配的部将冯礼作内应，打开城下小门，让曹操的三百多士兵进城，审配发现后，从城墙顶上用大石头砸门，将城门关闭，结果进城的曹兵全部战死。
五月，曹操毁去土山、地道，开凿壕沟，包围邺城，围圈达四十里。最初让挖得很浅，看去好像可以越过。审配在城上看见，放声大笑，没有派兵出来破坏。曹操派人乘夜疏浚，一夜之间，挖成深二丈、宽二丈的深壕，把漳河引入壕沟，完全断绝了邺城内外的联系。自五月到八月，城内饿死的人超过一半。
袁尚得知邺城危急，率领一万多人回救邺县，曹操迎面拦截，打败了袁尚，
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