笛声，从远方的菩提科特村传了过来。这悠扬的笛声，仿佛有着某种魔力，安抚着皮卡丘愤怒的心，三圣鸟的也停下了攻击。
不远处的三座自然圣殿，纷纷直射出一道冲天光柱，艳红色的火光柱、蓝白色的冰光柱、金黄色的电光柱。而在三道光柱与菩提科特村的祭典祭台四点的中心海域处，一股冲天水柱，隔在了皮卡丘和三圣鸟之间。
水柱中显现着一个巨大的阴影，并伴随着水中阴影发出空灵的吼叫声，水柱整个炸开。“昂啊——”空灵的鸣叫声，传遍了亚细亚岛附近的这片海域。水柱炸开，出现在众人面前的，是一只体型硕大的鸟形宝可梦。它通体是圣洁的白色，肚子上是天空的浅蓝，双眼的眼影是大海的蔚蓝。
竹韵站在小岛岸边，愣神地说：“这个叫声，和芙卢拉的笛声······”
“那就是风暴的化身，大海的主人，洛奇亚！原来是这样，二十多年前的风暴计划，就是为了它。”村长喃喃地说道。
叶音也跟着说道：“原来笛声，就是唤醒深海洛奇亚的关键。这下子，预言的内容又印证了一部分。”
“那个是······小智！”小绿猛然看见，相拥在一起的小霞、小智，被洛奇亚用超能力悬浮在空中。
洛奇亚意念一动，小智的宝贝球自行打开，喷火龙托着两人飞离了这片天空。
“皮卡，皮卡丘？（你救了小智？）”
“皮卡丘，回到小智的身边去吧，后面的战斗还需要你们的力量。（心灵感应）”洛奇亚用苍老的声音对皮卡丘说道。