金城府校尉。
大业十三年（617年）四月，时逢年荒民饥，陇西盗贼蜂起，金城县令郝瑗为讨伐贼寇招募兵卒数千人，并且任命薛举为将，分发铠甲，大集官民，摆设酒宴犒劳将士。
谁知薛仁杲与薛举及其同党十三人，在座中劫持郝瑗，假称收捕谋反之人，随即起兵，囚禁郡县官员，开仓散粮以赈济穷困百姓。
薛举自称西秦霸王，建年号为秦兴，封薛仁杲为齐公 ，小儿子薛仁越为晋公。别处贼寇宗罗睺率其众归附，封为义兴公。继而招附群盗，劫掠官马。兵锋甚锐，所至之处城池皆被攻下。
不久，薛举大败隋将皇甫绾，乘势攻陷枹罕。岷山羌钟利俗率众二万人归降薛举，薛举兵势大振。进封薛仁杲为齐王，授职为东道行军元帅，宗罗睺为义兴王，以辅佐薛仁杲。又以薛仁越为晋王，兼领河州刺史。接着又略取鄯、廓二州之地。不过十天，尽据陇西之地，拥兵十三万人。
大业十三年（617年）七月，薛举在兰州称帝，立薛仁杲为太子。 薛举派薛仁杲率兵围攻秦州，待薛仁杲攻克秦州之后，薛举便将都城从兰州迁至秦州。
据说薛仁杲此人生性贪婪残忍、嗜杀成性，尤其对俘虏经常施以断舌、割鼻、舂斮等酷刑。
大业十三年（617年）十二月，薛举派薛仁杲劫掠扶风郡，当地的农民起义军唐弼据守汧源抗击薛仁杲，导致薛仁杲不能进军。
起初唐弼拥立李弘芝为天子，拥兵十万人。奈何薛举派遣使者招降唐弼，唐弼杀害李弘芝向薛举请求投降。
谁曾想薛仁杲趁唐弼没有防备，率大军突袭汧源并且迅速攻下，收编了唐弼的全部部众， 此时薛举军势益盛，号称二十万兵众，筹划攻取长安。
唐弼见状无奈之下只好率领仅剩的数百名骑兵连夜逃走，向着大兴方向赶来，马不停蹄地赶到大兴之后，唐弼赶忙入城面见李渊，将此事告知，李渊收到消息后不由地大吃一惊。
由于自己一直忙于治理大兴，仓促之下竟然忘记了陇西方向还有薛举和薛仁杲两匹饿狼的事情了，想到这李渊一边安抚住唐弼，一边差人将李建成、李世民、李秀宁三人喊来，随后吩咐自己的管家连夜前往义宁坊的楚府，请楚墨风过来一同议事。
待到众人都到齐之后，李渊示意唐弼将方才说过的话又说给四人听，听完唐弼的叙述之后，四人均是眉头紧锁默不作声。
李渊见状只好开口说到：“都议一议吧，贼人携势准备趁咱们立足未稳之际攻打
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