田齐手下两方人马齐聚东莱，田齐连日召集沮授、苏双、颜雨、何丰、曹性、齐盛等四部主要官员，商议各部运作方式和彼此之间的联系机制，商讨各部、各司人员名单。将军府各部、各司、各曹主官各就其位，田齐制定的诸多政策终于顺利实施了起来。
沮授任军务部部长兼参谋司司长；高顺为训练司司长兼陷阵军府千户；魏风任军令司司长兼长林军府千户；何丰任装备司司长兼匠营千户。赵云、童飞、童猛、典韦、江成等府军千户皆兼任参谋司参谋，在战时负责协助沮授制定作战计划。
沮授征调各军府文职军官，迅速将军务部架构搭建了起来，并命魏风的长林军负责军务部护卫事宜。
高顺将四千丹阳兵打散分配至各千户府，组织各千户府进行军衔评定和作战训练。
何丰派手下各百户分赴莱州、青州各郡县，征集各地工匠，组建匠营千户府，开始建设军械工坊，生产兵器、甲胄，并组建府军护卫。
魏风将长林军一分为二，其中一部负责平时营地内卫，战时出征，另一部以队为单位派至各千户府，由督伯率领，负责维护各府军军纪、军法。
苏双任政务部部长兼户部分司司长；曹性任兵部分司司长、吏部分司司长兼锦衣卫千户；齐盛任礼部分司、刑部分司司长；谷琪任农部分司司长，负责管理各千户府农事；谷浩任畜牧分司司长，负责各千户府组建军马场；吕承任商务司司长；刘英任刑部分司副司长，组建警务千户府，负责案件侦破和治安维护；何丰兼任工部分司司长。
田齐还任命齐盛任法制部部长，同时兼任检察分司司长，组建法务学校，培训法官、检察官。任命童渊为科教部部长，颜雨、高顺为副部长，负责构建教育体系，管理教师，制定科研课题。
田齐在东莱发布征军令，征集水手并家眷两千户，补入童飞和江成的水军千户府。同时令童飞、江成自行组建造船厂，打造战船。
田齐依据后世经验，革新政治、军事体制，各部各司各曹主官无经验可循，只能摸着石头过河，不断试错纠错。田齐每天忙于理顺各部、各司杂务，片刻不得轻闲。
直到一个月后，各部各司的运转才渐渐步入正轨，结束了纷乱局面。田齐终于脱身出来，有了时间关注各千户府的训练，有了精力来考虑出海行商事宜。
田齐首先来到他的亲卫千户府鹰扬卫查看训练备战情况。鹰扬卫大部老兵由田岳率领留守塞外，田齐令甘宁、魏延在丹阳兵中遴选军士两曲，
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