教的总堂）主教樊国梁的建议下，列强遂于5月28日提出派出“使馆卫队”进入北京，清政府先是拒绝，后被迫于31日同意，但提出“每馆以二三十人为率”，结果列强先后派出400多人进京。后来列强又派遣西摩尔带领2000人前往北京，这些行为对清政府形成了严重威胁。对此，清政府一面继续发布镇压义和团的命令以消除列强派兵的理由，一面又调集军队进入北京以防不测。对外国人抱有敌意的董福祥所率领的武卫后军（甘军）即在6月9日被调入北京驻守，6月11日，日本书记官杉山彬前去迎接入京的西摩尔联军，在永定门外被甘军所杀。事后，大臣荣禄亲赴日本使馆道歉。
列强向北京强行进军和义和团抵御外**队，使清廷对义和团的态度开始出现转变。清政府于6月5日派赵舒翘和何乃莹，6月6日派刚毅去涿州“劝散”义和团，实为考察情况。结果刚毅的态度是“力言拳民可恃”，赵舒翘等也赞成采取招抚的措施。再加之载漪等官僚的鼓动，清政府逐渐开始承认义和团为合法组织。从6月10日起，在清朝官员的默许下，义和团开始大量进入北京。在初期，义和团与北京的外国人关系紧张，但并未发生大规模流血事件。
在使馆卫队入京后，以德国公使克林德为首的部分瓦德西
外国外交人员一味使用武力解决问题。6月14日，克林德带领水手一排行于内城之上，发现有沙地有义和团练习，即毫不迟疑发令开枪，当场打死二十余人（《庚子使馆被围记》）。此后使馆卫队开展了“猎取拳民行动”，多次主动攻击义和团员，结果导致愤怒的义和团在北京到处焚烧教堂和攻杀教民，并殃及今前门大街外的大栅栏地区，“京师富商所集也，数百年精华尽矣”。而克林德本人则在6月20日去总理衙门交涉时与神机营章京恩海相遇，并被后者射杀，酿成着名的“克林德事件”。
6月10日，列强不顾清政府的阻拦，正式组建八国联军，由在级别最高的英**官西摩尔为统帅，美**官麦卡加拉为副统帅，率军自天津向北京进发，有论者以此为八国联军侵华的标志。
当时，慈禧信任闭塞愚昧的守旧大臣，竟听信毓贤之言，相信团民能“刀枪不入”、“枪炮不伤”，欲借助义和团之力排外；她派军机大臣刚毅往涿州视察，刚毅回奏称：“天降义和团，以灭洋人”。在部分朝廷亲贵支持下，义和拳开始以“扶清灭洋”为口号，大举进京勤王，反抗外国列强国瓜分中国的行径。拆电线、毁铁路，并攻进天津租界，帝国主义列强入侵中
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