不管朝臣如何议论，朱由检的抗金总体战略是早已定下了的。说起来也很简单，就是老人家的十六字方阵！
这个战略同样分为四个阶段。第一个阶段是“敌进我退”，之前朱由检主动放弃大凌河、锦州、宁远，即是这一阶段的主要任务。道理也很简单，以大明现在的情况，根本无法支撑在辽东的长期消耗战。与其在那里耗尽国力，还不如暂时主动放弃，把拳头缩回来，积蓄力量后再次打出。
至于之后的后金军破关入寇，也在朱由检的算计之内。虽然这不可避免地会给百姓带来极大的损失，但中国幅员辽阔，战略纵深极大，后金突进来一两次，还不至于让大明亡国。
相反，后金虽然可以抢掠到很多财产甚至人口，但他们是远离后方，深入中原腹地作战，本身就有很大风险。而且只能以战养战，如果抢不到足够的军需品，立刻就会陷入困境。故而后金军肯定不会停留太长时间，仍是抢一把就跑的战略战术。所以朱由检其实并不怕皇太极从喜峰口闯进来，这仍属“敌进我退”的范围，只是准备不足，牺牲了大将赵率教，让他追悔不已。
但是这个“退”也不是无原则的逃跑主义，有两个重要的战略支点，朱由检无论如何不能放弃，那就是京师和山海关。京师就不用说了，那是大明帝国的象征，京师丢了，人心就散了，后面就只能是一路溃败，直到被彻底消灭。天子守国‘门’，意义正在于此。
而山海关的地理位置得天独厚，尽管后金军可以从别处绕过去，但山海关始终卡住了辽东与关内之间的“脖子”。有山海关，大明就保留着反击的跳板；山海关若失，恐怕辽东就再也无法收复了。
所以朱由检才会严令山海关守军不可轻举妄动，他是真怕祖大寿、满桂等部冒冒失失地起兵救援京师，结果在野战中被后金军消灭。
至于京师，扩建工程可不是白干的。虽然至今仍未完工，但朱由检有信心守住这座前无古人的城池。因此他不但不怕皇太极来打京师，相反他是怕皇太极不来京师，而去抢掠别的地方，那就真是大麻烦了。
在整个战略中，第一阶段最为重要。道理也很简单，如果第一阶段就崩溃了，也就没有后面的“敌驻我扰”、“敌疲我打”和“敌退我追”了。
现在后金军果然打过来了，惟一出乎朱由检意料的就是来得太早，京师准备尚不充分。在这种情况下，葡萄牙人运来的这批火器就显得十分重要了。如今蓟州已经陷落，后金军随时都有可能南下，切断京师到大沽的官道，
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