对传染病在人类发展史中扮演的角色，威廉·H·麦克尼尔在《瘟疫与人》一书中曾这样写道：“先于初民就业已存在的传染病，将会与人类始终同在，并一如既往，仍将是影响人类历史的基本参数和决定因素之一。”
以后世人的视角审视历史的走向，无论是被斯巴达打败而丧失领导地位的古雅典、在哥伦布发现新大陆后近乎灭绝的美洲原住民，或是曾作为古人类发祥地之一但在现代文明中处于落后地位的非洲，传染病均曾通过大量削减人口的方式在其文明演变中引发过连环效应。中国也自然逃不过。
原时空根据美国昆西大学远东史教授约瑟夫·H·查依照《资治通鉴》和《古今图书集成》整理的中国的疫情年表，从汉朝至清朝的两千年间，大范围暴发的瘟疫就达288次，它们有时会造成“十死六七”的后果。实际上，本时空这次南美鼠疫的爆发受到疫情影响的不光是巴拿马，整个欧洲包括阿拉伯世界都未能幸免，可以说是整个世界是一片哀鸿。
显微镜问世，让病毒传播的原理被大明的科学家解开。几十年来，随着大明医学界的解剖学、生理学、细胞学、细菌学和临床医学等领域不断进步，许多困扰人类上千年的难题得到了解答，比如说，1569年大明本土就基本消灭了天花，坚持了四十多年的”灭钉螺”运动，江南水乡的血吸虫病也基本上灭绝。年轻的一代江南人已经很少有人听说过“大肚子病”了。
由于太医院医学专家掌握了病菌传播的原理，因此，朝廷在爆发疫情之初就做好了充分的准备。防疫措施得力针对性强。因此，在大明本土并没有爆发鼠疫。尽管大明本土没有爆发鼠疫，也并非高枕无忧没受到影响。这场席卷全球的瘟疫使得所有的经济活动陷入停滞，海贸完全中断。
因此，商品经济高度发达的大明也不可避免的陷入了另一场危机之中。为了防疫，所有的对外贸易通道被关闭了，大明帝国也无可避免的被连累。首先引发这一危机的是上海证券交易所股价狂跌，一天之内一千六百多万股股票被抛售，四十多种主要股票的平均价格下跌了近25%。一夜之间，仿佛大明“繁荣”景象将会化为乌有。
全面的金融危机接踵而至：大批私立银行倒闭，企业破产，市场萧条，生产锐减；全国失业人数激增，人民生活水平骤降；农产品价格下跌，很多人濒临破产。从弘治年间开始到如今，大明老百姓享受了将近八十年的太平盛世，从来就没有人想到欣欣向荣的大明还会发生这样闻所未闻的事情。
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