同时，战争期间秦林要代表朝廷行使监军权力，根据将士的表现做出生杀黜涉的决定。
战后，记点斩俘缴获，上报兵部为立功将士请求封赏同样是督帅的职权，另外各军在战争期间花销的军费、消耗的兵器甲杖，也要由秦林审核认可之后，才能到户部核准报销。
“当年在浙东和倭寇大战，因为斩获的人头差了十三颗，末将被御史弹劾虚报战功，差点下狱论罪……”邓子龙说着说着就神色黯然，不过很快就开心的笑了：“这次闻得是秦督帅坐镇，末将喜不自胜，心头那点小九九也不瞒人，督帅在朝中何等威风，不是寻常人物可比的，料想此战之后，再没有谁来鸡蛋里挑骨头。”
刘綎也笑眯眯的道：“邓老叔说的不错。末将历次打仗，从来没有打败过，唯独战后报销时受够了户部司员的闲气，不知自掏腰包赔补了多少！现在好了，秦督帅在京师威风大、手面阔，画过押的报销，看户部哪个狗东西敢驳回来？”
因为秦林这个督帅的分量够重，行事有种种方便，所以邓子龙和刘綎非常乐意在他帐下听用。
原来如此，秦林这下明白了，他又问道：“那么，我怎么做，才能让将士们觉得放心，肯出力打仗呢？”
答案是尽量从容不迫，表现得对战事漠不关心，甚至装出胜败都无所谓的样子，将士们就会认为这位督帅来头很大，在朝中的根脚极深，那么打了胜仗自己应得的封赏不会打折扣，如果吃了败仗，有督帅顶在前头，朝廷不会过于迁怒，就算战死沙场，督帅也有向朝廷请到丰厚典恤的能力。
相反，如果督帅表现得过于关心胜败，将士们就担心他根脚不够深，一旦战事稍有不利就自身难保，那么到时候谁来替大家挡住朝廷的雷霆震怒，谁来替牺牲者留下的孤儿寡母请求典恤？
邓子龙表示，从来督师的文臣都会留在中军帐附庸风雅，峨冠博带的和幕府中的夫子们吟诗作对，这样做是有一定道理的，至少能给将士们带来信心，让他们相信督师的地位够高、根基够深。
当然，这和瞎指挥无关，比如英宗朝的大太监王振自我感觉太良好，搞起外行指导内行的一套，就弄出了土木之变。
刘綎补充说，当年王阳明督帅大军，除了定下大的战略之外，就是整天待在中军帐练气功，没事儿还要在深更半夜发出怪叫，结果将士们都相信他胸有成竹，于是士气大振，打败了反叛的宁王。
所以他提出建议，秦林可以仿效王阳明，在中军位置练练气功，假
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