皇帝的全面讨论，讨论的内容，引起了许多人的忌惮，这里面甚至包括了太子，其实皇帝讲的东西非常简单且清晰，百姓造反不是造反，而是为了争取自身权益的改天换日，这一行为是正义的，是值肯定的，甚至有史以来，所有为了反对朘剥、反对不公的造反，都是正义行径。
而且皇帝给出了非常完善的论证，以生产力和生产关系为主要叙事基础，进行了全面的论述。
朱常治将皇帝的社论拿给熊廷弼多少有点试探一下的想法，答案非常清晰，熊廷弼是典型的狂热帝党，皇帝说什麽都对，说什麽都只有拥护。
「那就没什麽好怕的了，我日後大抵要做点离经叛道的事儿，还请熊大将军护我周全了。」太子也给熊廷弼交了一个实底，他会秉承父亲的路线走下去，而且他的主张，可能比父亲还要过分、还要激进。
没别的原因，他是太子，只要他父亲还活着一天时间，他就可以继续套在德凉幼冲的壳子里，为所欲为，只要不被父亲所厌弃，他就可以将自己理念彻底贯彻。
「臣领陛下旨意而来，辅佐殿下梳理国政，此乃臣应有之义。」熊廷弼表述了自己的态度，只要陛下允许的，他都会支持，哪怕是粉身碎骨也在所不惜。
其实熊廷弼在返回大明的时候，也曾设想过自己的结局，狡兔死走狗烹是一种，还有一种是雪藏，大明该打的仗用了四十年，差不多已经打完了，连灭倭的最後一战，都是他熊廷弼收尾，已经没有用武之地的他，被雪藏，被逐渐地透明化，是另外一种下场。
熊廷弼可以坦然地接受所有结果，无论是雪藏还是被杀，他都无怨无悔。
但陛下给他的答案是，襄国公，到松江府辅佐太子，在太子回京的时候，主持开海大局，仍然一如既往地信任和委以重任，陛下的恩情根本还不完。
朱常治开始了他的治国，他开始对整个松江府进行大刀阔斧的改革，首先就是公司之法，工坊、商行、商帮等旧制废除，所有的工坊都必须登记造册，成立公司，这样一来，工坊的归属不再是个人、家族所有，而是集体所有，因为公司全面推行身股制。
万历三十九年十二月初，脱胎於身股制的公司法遭到了前所未有的反对，松江府无数商行、商帮开始联合抵制太子令，以停止生产要求太子收回成命。
太子不语，从各地调集了足够的物资，填补生产不足的短时缺口，而後下令到应天府、江左、江右、浙江三省两府之地的所有官厂，敞开了生产，填补生产空缺
…。。