竟爆了一个惊天大案出来。
原来，李毓昌刚刚到淮安府治山阳县时，便被山阳县知县王伸汉告知，自己可以在赈灾粮款之上，增加三分之一的数字，这样多余的赈灾粮款，便可以二人平分。李毓昌本是个清廉正直之人，听了王伸汉之语，当即严词拒绝，王伸汉多次相求，都被李毓昌无情推却。王伸汉情急之下，为了贪污公款，竟买通了李毓昌家人，在他饮食中下了毒，导致李毓昌一夜之间，突然暴毙。事后，王伸汉害怕李家追究，便买通了淮安知府王毂，求他帮助隐瞒此事，是以李家到淮安府质问之时，王毂当即将李家之人拒之门外。而这时的两江总督铁保、江苏巡抚汪日章，也都认为王毂与李毓昌非亲非故，不可能无故包庇凶手，于是面对李家的申辩，竟同样选择了置之不理。直到嘉庆亲自查案，这些内幕才浮出水面。
而就在李毓昌案爆发的同时，通州粮仓竟也出现了一件大案，经朝廷调查，通州一名书吏高添凤，利用自己长年看管通州粮仓之便，大量偷漏漕粮。而且，为了隐瞒自己偷漏粮食之状，高添凤数年以来，可谓无所不用其极，他将新入库的上等米高价贩售，又从市面上购入劣质陈米补充仓库，将兑取皇粮的米券做上记号，待自己亲信领米之时，便予以优待，甚至为了掩饰自己偷盗仓米之行，不惜买入大量药水，洒在仓米之上，使米粒膨胀，做出仓廪充实的假象。原本这些事高添凤已经做了七八年，一直无人知晓。可就在上一年，为了庆祝嘉庆五十大寿，朝廷特别下旨为官员多发俸米，这件事才意外出现了破绽。