李鸿章和左宗棠一模一样，都是遥控指挥战斗，左宗棠把前线的重任托付给刘锦棠，刘锦棠人称羽扇纶巾的周瑜，可谓军事奇才，深得大清将士的爱戴，对回军的战役，左宗棠完全可以高枕无忧。
而李鸿章还沒定下决心，台湾战事的组织有些杂乱无章，大清有数支军队在台湾作战，却沒有统一的调配，沒有发挥兵多将广的优势，反而龟缩在军事要塞里，任凭日军四处扫荡台湾东西部的少数民族地区。
现在名义上是由台湾镇总兵刘明灯统筹全局，但刘明灯勇猛有余，谋略不足，在他任职期间，台湾驻军与台湾少数民族之间摩擦不断，造成台湾少数民族成立排外的社团，台湾番邦与大清的关系降至冰点。沒有发扬礼仪上邦挥金如土的高尚品格，清廷寓教于人做得不够出色，使大清与台湾番邦之间有了嫌隙。
台湾番邦竟然说大清不讲信用，真是狗咬吕洞宾不识好人心。大清政府每年向台湾输送给养、物资，只让台湾百姓缴纳一点蔗糖，真是良心被狗吃了。
刘明灯只给朝廷发电报，要求援兵支援台湾，不断陈述日军有上万兵马，清军只有固守待援，好似守住战略要地，就是最大的功劳。刘明灯不敢和日军交战，接触战开打，便使出龟缩战术，二千清军主力固守在基隆港。
但是几位军机大臣早已做出过分析，台湾地荒民贫，人口稀少，粮食不能自给自足，是靠福建、广东调配，这才使得大清四千驻军得以在台湾、澎湖驻守。
日军若是出动上万人，要花多少人力物力运送粮草？小日本矮小瘦弱，一个人基本口粮就算是半斤，10000人就是5000斤粮食，一个月就是要150000斤粮食，要从日本本土或是琉球列岛把150000斤粮食运至台湾。战争还有惊人的损耗，运送150000斤粮食，至少要运送200000斤粮食，甚至更多，这后勤压力就会让日军崩溃。所以日军绝不会一次性出动一万人，还是相信英国人的情报，日军出动3000人马，已经到了日本军力的极限。
日军要是出动上万人马，就不是用來攻打生番之地，早就攻破台湾府，打到基隆港了。哪会在台湾的东西部和台湾的少数民族打得不可开交，日军只对排湾族施以血腥的报复，猛攻排湾族的领地，日军对于其他少数民族，采用互不侵犯的原则，反而使出糖衣炮弹，收买台湾少数民族的人心。
李鸿章不相信日本人有这么大胆量，敢对大清开战。大清的国力远在日本之上，直到现在日本人也不承认侵犯了大清的领
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