管帕劳群岛防御后将师团主力以及海上机动第1旅团部署于主岛，将第14师团的步兵第2联队与海军的第45基地警备特别陆战队部署于距离主岛50多公里的贝里硫岛，此外还有1个步兵大队部署昂格尔岛，日军只布防3个岛屿，其他岛屿太小，没有什么价值就懒得管了。帕劳群岛日军真正的防御重点是主岛巴伯尔土阿普岛与贝里硫岛，因为这2个岛都有机场，至于昂格尔岛也有修筑机场的条件所以日军也部署了1个大队。
精锐的第14师团布防帕劳后，开始积极进行备战训练，日夜不停地在各岛屿全面进行测量与攻防演习，熟悉地形环境，并利用韩国民工组成的工程队大量构筑防御工事，在昂格尔岛日军派驻了700多名韩国民工修筑工事，在贝里琉岛部署了3000多名韩国民工修筑工事，在巴伯尔土阿普岛有8000多韩国民工修筑工事。日军在帕劳虽然是积极备战，但并无真的会在帕劳群岛与美军干一仗的想法，普遍认为战争遥远的很，不过是训练外加熟悉太平洋战场作战环境而已。日军第14师团的官兵认为，日后很可能是会去增援外环日军，并在外环对美军展开激战。
然而1944年6月美军蛙跳过日军外环，直取塞班，由于塞班日军缺乏准备，弹药与部队不足，加上在战斗初期盲目轻敌，最后失败，随后关岛的架子货日军也被打垮，美军登陆部队虽然也遭到了严重损失，但由于在短时间就打下了马里亚纳群岛，获取了直接攻打日本本土以及破坏日本内防御圈的重要基地，并重创了由于塞班危急而仓促出击的日本海军联合舰队，士气大振。而日军战前制定的由外而内逐层抗击，消耗美军的计划彻底落空，至此太平洋战局急剧恶化，帕劳群岛已在美军兵锋之下