分维持原有的课程不变，只做微小的调整，被命名为文科。第二部分为制学部分，主要是教授科学文化知识的学习，定为理科。
以后每一个从这里毕业的学生都需要参加毕业考试，考试合格后颁发毕业证书。文科，理科成绩都要计入毕业成绩。只有文科，理科成绩全部合格，方能正式获得毕业证书，朝廷方可以授官。
两个月前，负责监国的朱厚炜罢免了原来的国子监祭酒，正式任命大儒蔡清为新任国子监祭酒，蔡清，字介夫，别号虚斋，明晋江人。三十一岁中进士，累官至南京文选郎中、江西提学副使，当代著名的理学家，儒客大家。
被调来国子监之前，蔡清是登莱行政学院第二任校长。他治学严谨，在床边设案置烛台，凡与学生讲论的问题，临寐前反复思考，若有所得即起床，点灯纪录备忘。
另外，朱厚炜另外还从登莱行政学院抽调来李廷机、张岳、林希元、 陈琛等二十八名教员成立国子监理科教研室，加入国子监教学工作，这二十八人都是登莱行政学院各学科的佼佼者，号称“登莱新学二十八宿”，在新学学员中名噪一时，很受学员喜爱。
简单的仪式后，在众人的簇拥下大家进入了国子监的教学区。齐王朱厚炜率先穿过一道色彩斑斓的牌坊，眼前出现了一个水池，水池中间有一名为“辟雍”的建筑。弘治十八年，孝宗朱祐樘命人在这里增建了这组皇家建筑，当时的弘治皇帝也打算改革国子监，在朝政不太忙的时候，他每月会抽一天时间来到这里给国子监的学生讲学。
“辟雍”四周建有一片圆形的池塘，以前弘治皇帝总会坐在正中央给学生讲学，学生们则跪在外面听。“辟雍”四周建有一片圆形的池塘，因为这儿是皇帝讲学的地点，讲堂等级必然得为全国最高的。有资格来听皇帝讲课的学子，大多都是皇帝选定的优秀学生，是那时候学生群体里的人上人。
今天，齐王就要在他父皇讲学的地方，发表他在国子监的第一场演讲，这种演讲的形式也是前所未有的，国子监的学生基本上都到齐了，除了监生以外，以蔡清为首的国子监教员，以李东阳、焦芳等内阁成员以及六部各长官，均悉数到场聆听齐王殿下的演讲。
……
巳时三刻，太阳透过树叶洒在整个”辟雍”里，显得斑斑点点，别有一番意境。这里已经人头济济，那些年轻的学子脸上洋溢着兴奋的表情，已经很久没有皇帝（齐王代皇帝讲学）来这里讲学了。齐王的到来，意味着国子监重新受到了朝廷的重视，也意味着
…。。